Cụ thể, mức phạt tiền đối với tổ chức (từ 1 - 100 triệu đồng) cao gấp đôi so với mức phạt tiền đối với cá nhân (từ 0,5 - 50 triệu đồng) cho cùng một hành vi vi phạm. Mức phạt tối đa chỉ được áp dụng trong trường hợp cá nhân hoặc tổ chức có hành vi chuyển giao công nghệ thuộc Danh mục công nghệ cấm chuyển giao.
Ngoài hình thức xử phạt bằng tiền, các tổ chức và cá nhân vi phạm còn phải thực hiện các biện pháp khắc phục hậu quả như: hoàn trả kinh phí bị chiếm dụng hoặc sử dụng sai mục đích; hủy bỏ các báo cáo không trung thực hoặc có số liệu bịa đặt; đăng ký và giao nộp kết quả thực hiện nhiệm vụ khoa học, công nghệ; hoặc các biện pháp khắc phục hậu quả khác theo quy định tại Luật xử lý vi phạm hành chính.
Nghị định cũng quy định thời hiệu xử phạt vi phạm hành chính trong lĩnh vực khoa học và công nghệ, chuyển giao công nghệ là 01 năm.
Nghị định này có hiệu lực từ ngày 15/08/2013, thay thế Nghị định 127/2004/NĐ-CP ngày 31/05/2004; Nghị định số 49/2009/NĐ-CP ngày 21/05/2009; và các khoản 3, 4 Điều 28 Nghị định số 84/2006/NĐ-CP ngày 18/08/2006.